細胞内の配列を解読!RNA-Seq解析
RNA-Seq解析は、細胞内のmRNAやmiRNAの配列を解読する技術であり、融合遺伝子の検出や新規と既知の転写産物の同定に加えて、遺伝子発現レベルと数来寝具パターンなどを解析します。
これによりがんの融合遺伝子の探索も可能となることから医学研究や医療において注目を集めています。
次世代シーケンサーを用いた解析を採用しており、全転写物の塩基配列を決定、得られたリード配列を参照配列にマッピングします。
また転写物へのアノテーションの付与に加えて、発現レベルの算出、転写物のアセンブリングまで対応するなど幅広いです。
またサンプルが複数ある場合の発現レベルの比較、RNAサンプルの品質に応じて最適化された方法を選択できます。
理研ジェネシスでは、研究所や医療機関向けにRNA-Seq解析を提供しており、高度かつ正確差で国内トップクラスの信頼を集めています。
解析決kはリード配列を参照配列に対してマッピングしますが、このさいにはスプライシングを考慮した上で行うため品質も極めて高く、ジャンクション構造予測も含まれます。
さらに発現レベルの比較など他、各種アノテーションをつけてテキストファイルならびにエクセル・マクロファイルにて提出するため、既存の環境でも利用しやすくなっています。
理研ジェネシスでは、RNA-Seq解析に力を入れており、医学研究や医療において欠かせない存在となりました。
今後も世界トップクラスの高い精度を誇る解析技術の発展が期待されています。